An Immune Multiobjective Optimization with Backtracking Search Algorithm Inspired Recombination

We propose a novel hybrid multiobjective (MO) immune algorithm for tackling continuous MO problems. Similarly to the nondominated neighbor immune algorithm (NNIA), it considers the characteristics of OM problems: based on the fitness values, the best individuals from the test population are selected and recombined to guide the rest of the individuals in the population to the Pareto front. But NNIA uses the simulated binary crossover (SBX), which uses the local search method. In our algorithm, the recombination is essentially inspired by the cross used in the backtracking search algorithm (BSA), but the adaptations are found in the immune algorithm. Thus, three variants are designed in this chapter, resulting in new recombination operators. They are evaluated through 10 benchmark tests. For the most advanced proposed variant, which is designed to have global search ability, results show that an improved convergence and a better diversity of the Pareto front are statistically achieved when compared with a basic immune algorithm having no recombination or to NNIA. Finally, the proposed new algorithm is demonstrated to be successful in approximating the Pareto front of the complex 10 bar truss structure MO problem

Production, analyse structurale et caractérisation fonctionnelle d'oncoprotéines E6 issues de différents papillomavirus

Autrefois rattachés aux papovaviridae avec les polyomavirus, les papillomavirus sont individualisés depuis peu et forment l'unique genre de la famille papillomaviridae. Les papillomavirus (PVs) induisent chez les mammifères et les oiseaux des lésions prolifératives dans les tissus épithéliaux. La plupart de ces lésions sont bénignes (verrues et condylomes) mais elles dégénèrent parfois en cancers. Les papillomavirus humains (HPV) génitaux à haut risque sont responsables de 99% des cas du cancer du col de l'utérus, deuxième cause de mortalité chez la femme. Certains HPV cutanés à haut risque provoquent également des cancers de la peau. Les oncoprotéines E6 et E7 sont particulièrement impliquées dans le processus de carcinogenèse, en interagissant notamment avec les protéines anti-tumorales p53 et pRb. Cependant, E6 et E7 lient et souvent provoquent la dégradation d'environ 100 autres protéines cellulaires régulant elles-mêmes l'expression, la stabilité ou les modifications posttranscriptionnelles d'autres protéines. La structure de E6 a longtemps résisté à toute analyse, car la protéine était très difficile à produire par voie recombinante sous une forme repliée. Notre équipe a travaillé sur ce problème depuis 1995. Les travaux que j ai menés durant cette thèse ont permis de compléter l'étude structurale et fonctionnelle de la protéine E6 du HPV et d'aborder des études comparables pour ses orthologues de différents virus animaux. De telles données constituent un progrès considérable attendu depuis une vingtaine d'années. L'optimisation des protocoles, l'exploration des domaines, la mutagenèse dirigée et la solubilisation des protéines à l'aide de leurs ligands, se sont avérés essentiels pour aboutir à l'étude structurale. Remarquablement, pour produire et solubiliser des protéines relativement proches, il m'a fallu adopter différentes stratégies. D autre part, la maitrise de la production et de la qualité de ces protéines m'a permis d'étudier le rôle biologique de certains phénomènes (dimérisation, liaison à LXXLL' ), par une approche de mutagénèse respectueuse du bon repliement des protéines.Pas de résum

Production, analyse structurale et caractérisation fonctionnelle d'oncoprotéines E6 issues de différents papillomavirus

Autrefois rattachés aux papovaviridae avec les polyomavirus, les papillomavirus sont individualisés depuis peu et forment l unique genre de la famille papillomaviridae. Les papillomavirus (PVs) induisent chez les mammifères et les oiseaux des lésions prolifératives dans les tissus épithéliaux. La plupart de ces lésions sont bénignes (verrues et condylomes) mais elles dégénèrent parfois en cancers. Les papillomavirus humains (HPV) génitaux à haut risque sont responsables de 99% des cas du cancer du col de l utérus, deuxième cause de mortalité chez la femme. Certains HPV cutanés à haut risque provoquent également des cancers de la peau. Les oncoprotéines E6 et E7 sont particulièrement impliquées dans le processus de carcinogenèse, en interagissant notamment avec les protéines anti-tumorales p53 et pRb. Cependant, E6 et E7 lient et souvent provoquent la dégradation d environ 100 autres protéines cellulaires régulant elles-mêmes l expression, la stabilité ou les modifications posttranscriptionnelles d autres protéines. La structure de E6 a longtemps résisté à toute analyse, car la protéine était très difficile à produire par voie recombinante sous une forme repliée. Notre équipe a travaillé sur ce problème depuis 1995. Les travaux que j ai menés durant cette thèse ont permis de compléter l étude structurale et fonctionnelle de la protéine E6 du HPV et d aborder des études comparables pour ses orthologues de différents virus animaux. De telles données constituent un progrès considérable attendu depuis une vingtaine d années. L optimisation des protocoles, l exploration des domaines, la mutagenèse dirigée et la solubilisation des protéines à l aide de leurs ligands, se sont avérés essentiels pour aboutir à l étude structurale. Remarquablement, pour produire et solubiliser des protéines relativement proches, il m'a fallu adopter différentes stratégies. D autre part, la maitrise de la production et de la qualité de ces protéines m'a permis d étudier le rôle biologique de certains phénomènes (dimérisation, liaison à LXXLL ), par une approche de mutagénèse respectueuse du bon repliement des protéines.STRASBOURG-Sc. et Techniques (674822102) / SudocSudocFranceF

An Inverse Source Problem for Singular Parabolic Equations with Interior Degeneracy

The main purpose of this work is to study an inverse source problem for degenerate/singular parabolic equations with degeneracy and singularity occurring in the interior of the spatial domain. Using Carleman estimates, we prove a Lipschitz stability estimate for the source term provided that additional measurement data are given on a suitable interior subdomain. For the numerical solution, the reconstruction is formulated as a minimization problem using the output least squares approach with the Tikhonov regularization. The Fréchet differentiability of the Tikhonov functional and the Lipschitz continuity of the Fréchet gradient are proved. These properties allow us to apply gradient methods for numerical solution of the considered inverse source problem